Las cabezas de Miosina están ordenadas helicoidalmente sobre el backbone de los filamentos gruesos en estado relajado. Cuando se activan los filamentos, las cabezas se desprenden del backbone y se desordenan. Microscopia electrónica (EM) realizada en Miosina de músculo liso de pollo reveló que en el estado relajado (desfosforilado), las dos cabezas establecen la estructura de "interacción" asimétrica. La estructura con el motivo de interacción de las cabezas se ha observado en otras moléculas de Miosina aisladas (vieira, tarántula, Limulus, y músculos esqueléticos y cardíacos de ratón) y en los filamentos gruesos de músculo cardíaco de ratón, músculo estriado de Limulus y vieira, y músculo estriado de escorpión, apoyando el concepto de que este motivo es altamente conservado y subyace en el estado de relajación de los filamentos gruesos en los músculos lisos y estriados en una amplia gama de especies. Existen interacciones intramoleculares (entre dominios de una misma molécula de Miosina) e interacciones intermoleculares (entre dominios de una molécula de Miosina y dominios de otra molécula de Miosina adyacente). Estas interacciones se rompen cuando se activa la Miosina.

Durante este seminario se expuso el proceso a través del cual se obtuvieron las secuencias de Miosina de todas las especies disponibles, para analizar cómo estas interacciones se establecen como interacciones iónicas, principalmente debidas a los residuos conocidos por ser cargados electrostáticamente (ácido glutámico y ácido aspártico, con cargas negativas, y arginina y lisina con cargas positiva). Usando las secuencias de la cadena pesada de Miosina (Dan Qi), ELC y RLC (Zhu et al. 2009) de la especie Aphonopelma, y el modelo homólogo respectivo obtenido por Dan Qi y Lorenzo Alamo, ajustado flexiblemente al mapa 3D con la ayuda de Willy Wriggers.

Se determinaron los péptidos equivalentes de las interacciones para la secuencia de miosina de Aphonopelma en cada cadena realizando alineamientos con las secuencias de humano y pollo, a partir de las interacciones sugeridas en Alamo et al. 2008, y otras referencias (Wendt et al. 2001, Liu et al. 2003 and Jung et al. 2008), que contienen las especificaciones de residuos pertenecientes a secuencias de humano y pollo.

Finalmente se analizaron las interacciones utilizando este modelo atómico de Aphonopelma, revisando los péptidos y residuos cargados en cuestión, así como las distancias y otros residuos más cercanos de cada zona de interacción con el software UCSF Chimera, y realizando alineamientos de secuencias con el software Jalview para todas las secuencias disponibles de otras especies de manera de comprobar la conservación de los residuos cargados.

Todas las secuencias disponibles de otras especies fueron obtenidas del NCBI realizando una búsqueda BLASTP, luego los resultados descargados fueron procesados por un programa implementado en el lenguaje de programación Java, para realizar una clasificación identificando términos distintivos que coincidan con el tejido o tipo de músculo, y para almacenar los datos en una base de datos creada con el manejador de base de datos PostgreSQL.

CV

ESTUDIOS REALIZADOS

Institución de Educación Superior: Universidad de Oriente, Núcleo Anzoátegui.
Fecha: Noviembre 2002 - Abril 2008.
Título obtenido: INGENIERO EN COMPUTACIÓN. Promedio: 8,23. Escala numérica (0-10 puntos). Rango de promoción: 1. Número de egresados: 7.

Actualmente realizando estudios de postgrado: TELECOM SudParis. Évry, Francia.
Maestría en Procesamiento Automático de Datos, para el área de Bioinformática.
Becada por la Fundación Gran Mariscal de Ayacucho.

PREMIOS Y DISTINCIONES

Primera graduada con honores en la carrera Ingeniería en Computación de la Universidad de Oriente, mención Cum Laude.

EXPERIENCIA LABORAL

1.- Institución: IVIC (Instituto Venezolano de Investigaciones Científicas).
Fecha: Desde Enero del 2009 (actualmente con permiso, desde Agosto del 2009 para realizar estudios de postgrado).
Nombre del cargo: PAI. Profesional Asociado a la Investigación en el Laboratorio de Estructura Supramolecular del Centro de Biología Estructural.

2.- Institución: Misión Sucre.
Fecha: Noviembre 2008 - Julio 2009.
Nombre del cargo: Profesora de las materias Alfabetización Tecnológica y Sistemas II.

3.- Institución: Manapro Consultores C.A.
Fecha: Agosto 2008 - Enero 2009.
Nombre del cargo: Analista de Proyectos. Actualizando y desarrollando nuevas funcionalidades para el sistema informático de la empresa cliente Telefónica - Venezuela.

4.- Institución: Saetha Design & Systems.
Fecha: Septiembre 2006 - Agosto 2008.
Nombre del cargo: Coordinadora de Investigación. Realizando investigaciones y evaluaciones de nuevas tecnologías, diseñando y programando aplicaciones web y de escritorio.

5.- Institución: Universidad de Oriente.
Fecha: Octubre 2004 - Septiembre 2006.
Nombre del cargo: Preparadora de las materias Programación Orientada a Objetos, Objetos y Abstracción de Datos, Computación Básica y Programación I.