CENTRO DE BIOLOGIA
ESTRUCTURAL
Humberto Fernández-Morán
Seminarios Externos
Prof. PETER ROEPSTORFF
Departamento de Bioquímica y Biología Molecular
De la Universidad de Dinamarca del Sur.
"PROTEOMICS,
WHERE ARE WE, POSSIBILITIES AND LIMITATIONS"
31 de octubre de 2011

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El Conferencista: El Prof. Peter Roepstorff es reconocido a nivel mundial como uno de los gestores e impulsores de la proteómica como versión de alto rendimiento de procesamiento de la Bioquímica. En su laboratorio se han formado muchos de los grandes trabajadores del área y cuenta con mas de 450 publicaciones en la materia. Adicionalmente es un gran asesor y colaborador a nivel internacional. La Conferencia: La proteómica se basa en la combinación de la información de la secuencia genómica con la información generada por Espectrometría de Masas (MS) en identificaciones a gran escala de las proteínas y sus modificaciones. En la conferencia se indicarán las distintas técnicas y sus alcances mediante ejemplos.
Proteomics is based upon
combining the information from genome sequencing with the information
generated by MS for large scale identification of proteins and their
modifications. Two strategies dominate in proteomics, one based on separation
or the proteins by 2D-PAGE prior to protein identification and characterization
by mass spectrometry, the other based on proteolytic digestion of all
the proteins in a sample followed by separation and sequencing of the
resulting peptides by multidimensional LC-MS. A number of intermediate
strategies are also used. Different strategies will be described and
their strengths and limitations evaluated for the use on different levels
in peptide and protein characterization and proteomics. Assignment of
post translational modifications is a special challenge because these
often are present in sub-stoichiometric amounts and consequently are
low abundant. MS is also a powerful tool for studies of proteins for
which no sequence information is available in databases. In this case
de novo sequencing is required for subsequent identification by homology
search or for cloning. |